Τρίτη 1 Ιανουαρίου 2019

Gene Editing in Clinical Practice: Where are We?

Abstract

Multitude of gene-altering capabilities in combination with ease of design and low cost have all led to the adoption of the sophisticated and yet simple gene editing system that are clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-associated protein 9 (CRISPR). The CRISPR/Cas9 system holds promise for the correction of deleterious mutations by taking advantage of the homology directed repair pathway and by supplying a correction template to the affected patient's cells. CRISPR is a tool that allows researchers to edit genes very precisely, easily and quickly. It does this by harnessing a mechanism that already existed in bacteria. Basically, there's a protein that acts like a scissors and cuts the DNA, and there's an RNA molecule that directs the scissors to any point on the genome one wants which results basically a word processor for genes. An entire gene can be taken out, put one in, or even edit just a single letter within a gene. Several platforms for molecular scissors that enable targeted genome engineering have been developed, including zinc-finger nucleases, transcription activator-like effector nucleases and, most recently, CRISPR/CRISPR-associated-9 (Cas9). The CRISPR/Cas9 system's simplicity, facile engineering and amenability to multiplexing make it the system of choice for many applications. CRISPR/Cas9 has been used to generate disease models to study genetic diseases. Improvements are urgently needed for various aspects of the CRISPR/Cas9 system, including the system's precision, delivery and control over the outcome of the repair process. However, there are still some glitches to be mended like how to regulate gene drives and its safeguards. The creation of gene knockouts is one of the first and most widely used applications of the CRISPR–Cas9 system. Nuclease-active Cas9 creates a double-strand break at the single guide RNA-targeted locus. These breaks can be repaired by homologous recombination, which can be used to introduce new mutations. When the double-strand break is repaired by the error-prone nonhomologous end joining process, indels are introduced which can produce frame shifts and stop codons, leading to functional knockout of the gene. Precedence modification have to be done on mechanism of CRISPR/Cas9, including its biochemical and structural implications incorporating the latest improvements in the CRISPR/Cas9 system, especially Cas9 protein modifications for customization. Current applications, where the versatile CRISPR/Cas9 system is to be used to edit the genome, epigenome, or RNA of various organisms is debated. Although CRISPR/Cas9 allows convenient genome editing accompanied by many benefits, one should not ignore the significant ethical and biosafety concerns that it raises. Conclusively lot of prospective applications and challenges of several promising techniques adapted from CRISPR/Cas9. Is discussed. Although many mechanistic questions remain to be answered and several challenges to be addressed yet, the use of CRISPR–Cas9-based genome technologies will increase our knowledge of disease process and their treatment in near future. Undoubtedly this field is revolutionizing in current era and may open new vistas in the treatment of fatal genetic disease.



http://bit.ly/2VnsHJh

High Sensitivity C Reactive Protein: An Adjunct Diagnosis in Ruling Out Pediatric Tuberculosis

Abstract

The utility of C-reactive protein (CRP) as a marker of disease severity, therapeutic response and prognosis in tuberculosis has been suggested. This study aims to determine the levels of high sensitivity CRP (hs CRP) among the pediatric tuberculosis cases. A case control study was conducted on 60 clinically diagnosed (clinical findings and radiography and/or contact history and/or Mantoux test) or microbiologically confirmed (smear and/or culture and/or Cartridge based Nucleic Acid Amplification test positive) pediatric tuberculosis cases ≤ 12 years. hs CRP levels were estimated in the cases and healthy controls using ELISA. Median levels of serum hs CRP were significantly higher in pediatric tuberculosis cases (25 mg/l) as compared to controls (0.530 mg/l). No significant correlation was found with age, gender, site of tuberculosis or presence of dissemination. Lower levels were found with palpable lymphadenopathy. Levels were not significantly different between microbiologically confirmed cases and those who were negative by one or more of the microbiological tests of staining, culture and cartridge based nucleic acid amplification test. hs CRP can be used in diagnostic algorithms of pediatric tuberculosis to rule out tuberculosis. Further studies could help in determining the prognostic and therapeutic response of hs CRP among children leading to better management.



http://bit.ly/2QhvEHi

Pediatric cystic diseases of the kidney

Abstract

Pediatric renal cystic diseases include a variety of hereditary or non-hereditary conditions. Numerous classifications exist and new data are continuously published. Ultrasound is the primary technique for evaluating kidneys in children: conventional and high-resolution US allows a detailed visualization of renal parenchyma and of number, size and location of the cysts, hence representing the most important diagnostic imaging technique for the first diagnosis and follow-up of these young patients. The purpose of this pictorial essay is to review the spectrum of renal cystic lesions in children from simple, complex or malignant single cysts to the several poly/multicystic kidney diseases.



http://bit.ly/2Swbbk3

Novel method for analyzing the behavior of composite beams with non-smooth interfaces

Abstract

An almost exact solution is derived for the forced vibration of a composite beam with periodically varying non-smooth interface through a moderate weak-form formulation. The material property of a non-uniform beam is characterized by its flexural rigidity function R(x). In the novel method, R(x) is relaxed to be an integrable function rather than a \({\mathcal{C}}^2\) smooth function in the usual approach. The R(x)-orthogonal bases in the linear span of all boundary functions are derived such that the second-order derivatives of the bases elements are orthogonal with respect to the weight function R(x). When the deflection of the beam is expressed in terms of the bases, the expansion coefficients can be determined exactly in closed form owing to the R(x)-orthogonality of the bases. The solution obtained is almost exact, since its accuracy can be up to the order \(10^{-15}\) . This powerful method is used to analyze the forced vibration behavior of composite beams with three different periodic interfaces.



http://bit.ly/2RpKUq9

هفت باور نادرست درباره سرقت علمی - نیتیو پیپر

هفت باور نادرست درباره سرقت علمی

مانند سایر موضوعات، بدفهمی‌ها و باورهای نادرست زیادی درباره سرقت علمی وجود دارد. با نادیده گرفتن قانون حق تألیف که به‌روشنی مجازات‌های سرقت علمی را تبیین کرده است، بسیاری از پژوهش‌گران خود را به‌طور جدی دچار دردسر می‌کنند. علی‌رغم آگاهی از نادرست بودن باورهای زیر، بسیاری از افراد آن‌ها را توجیهی برای سرقت‌های علمی می‌دانند. سرقت علمی از جمله پدیده‌هایی است که مردم دوست ندارند در کلاس درس یا محل کار درباره‌اش صحبت کنند. در اینجا، هفت باور نادرست درباره سرقت علمی مرور می‌شوند، پس با نیتیو پیپر همراه باشید.

هفت باور نادرست درباره سرقت علمی

۱- تنها محتوایی که مالکیت خصوصی دارد را نمی‌توان سرقت کرد

سرقت علمی و کپی‌رایت در این زمینه وجه اشتراک دارند. برخی فکر می‌کنند اگر اثری تحت مالکیت عمومی بوده یا مدت زمان مشخصی از انتشارش گذشته باشد، نیازی نیست به نام صاحب اثر اشاره کنند. هرچند در این حالت حق تألیف را نقض نکرده‌اید، با این حال، حتی اگر نویسنده اثر سال‌ها پیش فوت کرده باشد یا اثر تحت مالکیت عمومی باشد، باز هم باید به نام وی اشاره کنید؛ در غیر این صورت، مرتکب سرقت علمی شده‌اید.

۲- تنها باید نقل قول‌های مستقیم را ارجاع‌دهی کرد

بسیاری از دانشجویان تنبل که از ارجاع دادن بیزارند همیشه در اینجا قربانی می‌شوند. آن‌ها فکر می‌کنند تنها باید نقل قول مستقیم را ارجاع‌دهی کنند. بنابراین، با پارافریز کردن کل اثر از نقل قول مستقیم فرار می‌کنند. اما واقعیت این است که کلمات ابزارهای انتقال دادن، قرض گرفتن و اشتراک‌گذاری ایده‌ها و افکارند. ارجاع دادن کمک می‌کند سایر افراد محل دقیق منبع شما را پیدا کنند. بنابراین، حتی اگر کار را پارافریز کنید و به منبع‌تان ارجاع ندهید، مرتکب سرقت علمی شده‌اید.

۳- سرقت علمی تصادفی اهمیتی ندارد

حتی پس از پارافریز کردن، شباهت‌هایی که با متن اصلی وجود دارد قابل ردگیری‌اند. حتی اگر برای پارافریز کردن تلاش زیادی انجام دهید، باز هم سرقت علمی صورت گرفته است. برخی اوقات، مشابهت یاب‌های آنلاین مواردی از شباهت را ردیابی می‌کنند که باعث شگفتی شما می‌شود. ممکن است به علت ثبت نکردن منابع پژوهشی از ابتدای نوشتن مقاله، آن‌ها را گم کرده باشید. اینجا جایی است که ادعای بی‌گناهی می‌کنید. ممکن است از سرقت علمی اجتناب کرده باشید، اما واقعیت این است مرتکب خلاف شده‌اید و ممکن است جریمه‌ای سنگین در انتظارتان باشد. سرقت علمی تصادفی یا غیرتصادفی مهم نیست؛ مقاله همچنان سرقتی است.

۴- اینترنت یعنی دانش مشترک

بسیاری از دانشجویان گمان می‌کنند که چون اینترنت رایگان و دسترسی به آن برای همه آزاد است جزئی از دانش عمومی به حساب می‌آید و نیازی نیست اطلاعات استخراج‌ شده از آن را ارجاع‌دهی کنند. دانش مشترک تعریف خاص خود را دارد. دانش مشترک یعنی اطلاعات و حقایقی که برای همه آشناست و در تمام کتاب‌های مرجع در دسترس عموم است و به‌راحتی می‌توان آن را بازیابی کرد. بنابراین، باید تمام منابع اطلاعاتی اینترنتی را ارجاع‌دهی کرد.

۵- سرقت علمی از خود مهم نیست

بسیاری از دانشجویان عادت کرده‌اند که مقاله خود را بازنویسی و در ژورنال‌های متعدد سابمیت کنند. این کار نوعی سرقت علمی آکادمیک است. بسیاری از افراد این ادعا را که چیزی از دیگران سرقت نشده است قبول ندارند. کپی‌برداری از کارهای خودتان و بازنویسی کردن‌شان ممکن است دردسرساز شود. بیشتر نویسندگان از فرصت سوء استفاده می‌کنند و از کارهای‌شان مجدداً استفاده می‌کنند. به همین دلیل، بسیاری از نشریات قانون‌هایی دارند که مانع از استفاده مجدد از آثار پیشین می‌شوند، مگر آنکه به روشنی به آن‌ها ارجاع‌دهی شده باشد.

+بیشتر بخوانید: سرقت علمی از خود یا self-plagiarism چیست و چرا باید از آن اجتناب کرد؟

۶- هم می‌توانم از ارجاع‌دهی درون‌متنی استفاده کنم و هم از کتاب‌شناسی

بسیاری از دانشجویان فکر می‌کنند می‌توانند یکی از این دو شیوه را به کار ببرند. واقعیت این است که ژورنال‌ها هم ارجاع درون‌متنی و هم کتاب‌شناسی را الزامی می‌دانند. ارجاعات درون‌متنی نشان می‌دهند که محتوای قرض‌ گرفته‌ شده کجا آغاز می‌شود و کجا پایان می‌یابد. کتاب‌شناسی به مخاطب نشان می‌دهد که چگونه می‌توانند به منابع استفاده‌ شده دسترسی پیدا کنند.

۷- سرقت علمی تنها در کشورهای غیرانگلیسی‌زبان رایج است

موانع زبانی تا حدی در این مسئله نقش داشته است. این باور تا حدی درست است. پژوهش‌گرانی که کارهای‌شان را به انگلیسی آماده می‌کنند با مسائل متعددی مواجه می‌شوند که آن‌ها را در معرض سرقت علمی قرار می‌دهد. ممکن است به دلیل کمبود اعتماد به نفس مرتکب این عمل شوند. با این حال، واقعیت این است که سرقت علمی مسئله‌ای جهانی است، و هم در کشورهای انگلیسی‌ زبان اتفاق می‌افتد و هم در کشورهای غیرانگلیسی‌ زبان.

سرقت علمی مجازات دارد. مهم نیست در کجا اتفاق افتاده است. بنابراین، پیشنهاد می‌شود از استادان دانشگاه کمک گرفته شود. مطمئن شوید که باورهای درست و نادرست درباره سرقت علمی و مجازات‌های آن را مطابق با قانون حق تالیف درک کرده‌اید. ویراستاران باید پژوهش‌گران را توجیه کنند که سرقت علمی چه تاثیر نامطلوبی بر صاحبان اصلی آثار دارد.


http://www.nativepaper.ir/%d9%87%d9%81%d8%aa-%d8%a8%d8%a7%d9%88%d8%b1-%d9%86%d8%a7%d8%af%d8%b1%d8%b3%d8%aa-%d8%af%d8%b1%d8%a8%d8%a7%d8%b1%d9%87-%d8%b3%d8%b1%d9%82%d8%aa-%d8%b9%d9%84%d9%85%db%8c/

Intelligent tribological surfaces: from concept to realization using additive manufacturing

Abstract

In this paper, we provide a detailed account of our efforts in the design, development and prototyping of a novel intelligent surface by adapting initially curved diaphragms. Unlike the shortcomings that characterize current designs of functional surfaces, our adaptive surface design is characterised by simplicity, multifunctionality, adaptability, high flexibility and robustness as well as controlled autonomy. Four aspects of the work are accordingly examined. The first is concerned with the conceptual design of the new functional surface. The second with the development of functional prototypes of intelligent surfaces, showing its characteristics and ease of manufacturing using 3D additive manufacturing. The third with demonstrating the multi-frictional ability of the newly designed surface. Our friction test results show wide range friction control ability from the friction coefficient value 0.3 (same value of material itself) to 3 times higher value 1.1. Finally, we address the challenges that are faced in our new design and the efforts that are currently being adopted to overcome them.



http://bit.ly/2Aom14s

Temporal popularity prediction of locations for geographical placement of retail stores

Abstract

Modern retail chains, such as Starbucks and McDonald's, seek for geographical locations that have higher possibility to bring the maximum profit to establish and open their new stores. For a retail store, the common indicator of profit is its popularity which can be measured by the number of people who had ever consumed there. If one can know the potential popularity of locations along the time or within a certain time period (e.g., Christmas holiday or some memorial days) in advance, it would facilitate the determination of locations that are more profitable for the geographical placement of new retail stores. In this paper, given a targeted retail chain as well as some candidate locations, we propose to predict the popularity values of these locations over time to support their decisions on placing new stores. We devise a semi-supervised learning model, Affinity-based Popularity Inference, to tackle the Temporal Location Popularity Prediction problem. The basic idea is that locations that share similar properties of geo-spatial venue characteristics and human mobility tend to have closer popularity values. Experiments conducted on Foursquare check-in data in New York City exhibit promising results on predicting the temporal popularity of retail chains Starbucks, McDonald's, and Dunkin' Donuts, comparing to interpolation, regression, and state-of-the-art supervised learning methods.



http://bit.ly/2SvdjIW

Δημοφιλείς αναρτήσεις